Bioconductor 西湖大学镜像无法下载安装 R 包
Bioconductor 为高通量基因组数据的分析和可视化提供开源工具。Bioconductor 多数软件包采用 R 统计编程语言开发。Bioconductor 每年释出两个版本，并有活跃的用户社区。 由于 Bioconductor 的 rsync 上游会自行删除非最新的版本，大部分镜像站仅提供 Bioconductor 的当前最新版本和开发版本，只有少量镜像站点会保留过时的版本。目前已知西湖大学…
Steven Shum
A Bioinformatics Engineer.
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180 179 用 Docker 来解决 LinearDesign 的 GLIBC 版本过低问题
LinearDesign 是一款用于优化 mRNA 设计的软件，旨在提高 mRNA 的稳定性和免疫原性。该项目由 He Zhang、Liang Zhang、Ang Lin 等研究人员开发，并已在 Nature杂志上发表相关研究成果。LinearDesign 通过算法优化 mRNA 序列，使其在保持高翻译效率的同时，具有更好的结构稳定性。 GitHub 地址： 确保你的系统满足以下依赖要求： Cla…
178 丙午马年 2026 春节
丙午年是中国传统干支纪年体系中的第 43 个组合，以天干“丙”与地支“午”相配构成双火格局，对应生肖马，故称火马年或赤马年，每 60 年循环出现于 1906、1966、2026 等年份。 2026 年的春节转眼就过去了，还在初六的时候就已经感受到即将要上班的无力和抗拒。 和往年不一样的是，今年的回老家选择高铁+顺风车的方式。提前一周的时间成功候补了一家三口的三张高铁票，加上顺风车到家门的 1.5H…
2 comments177 我的博客图床新方案 R2-Explorer
博客站点 图床的问题，纠结了很久，也一度以为很难会找到一个自己满意的 Pages 工具。但幸运的是，2025 年 12 月时候看到了 R2-Explorer 这个基于 Worker 的 Cloudflare R2 存储管理工具，部署完成后一番体验下来，发现这就是我一直要找的图床。 首先，它是基于 GitHub Actions 部署到 Cloudflare 的 Workers 边缘计算平台上，通过绑…
176 年底迷思
此时此刻，距离 2026 年的春节还剩大约 2 周的时间，记录一下这段时间的一些糟心。 上一篇 文章的 X 项目，终于是走到了最后阶段，在年底这个节骨眼，细枝末叶的琐事一件接一件，压得喘不过气。 加班好像成了常态。 一月上旬频繁人事变动和压抑带来的躁动和不安，随着时间竟有种事过境迁，淡忘如水的错觉，时间静默地抚平一切波澜。 心底依旧割裂，永远摸不到安全的边界。 生活愧歉良多。
175 2025 致敬每一个人都在拼命地苟活着人
千言万语，无从下笔！ 2025 已接近尾声，在这个时间节点，也确实该对自己做一个阶段性的总结了，也顺便对我的来时路做个回顾。2025 对于个人来说，可以用几个关键词串起来：AI、社区开源、项目、户外徒步。 2025 年初，DeepSeek 爆火让各大公司开始对 AI 趋之若鹜，蠢蠢欲动。对于我自己来说，最开始，完全是出于个人兴趣，陆陆续续对着 Ollama、OpenWebUI、AnythingLL…
1 comment174 每周一山 | 广州龙渔线徒步
广州龙渔线是一条从龙眼洞至渔沙坦的城郊徒步路线，全长约12公里。它以交通便利、难度适中著称，串联起山林、水库与陡峭石壁，其中二战碉堡遗址是途中标志景观。 我们这一次走的是从植物园 → 鬼王山 → 龙洞（民族文化村）总站的路线 —— 从地铁 6 号线看植物园的下一站就是龙洞，相当于绕一圈就走了一站地铁站。 搭乘地铁6号线植物园G出口出来，从旁边的宝翠园进去，穿过广东工业大学（龙洞校区）。 穿过广东工…
173 Python 包和项目管理工具 UV 安装与更新
uv 有人评价是近十年来 Python 生态出现的最好东西，它彻底改变了 Python 的安装和使用方式，尤其在快速解决依赖冲突（这对大型项目至关重要）方面，速度快得惊人。作为一个由 Astral 开发，用 Rust 编写，几乎可以在任何操作系统或平台上运行的免费的开源工具，个人在越来越多的开源模型、项目中都能看到它的身影，uv 似乎已经和 conda 成为了现在 Python 环境构建与管理的标…
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