Bioconductor 西湖大学镜像无法下载安装 R 包
Bioconductor 为高通量基因组数据的分析和可视化提供开源工具。Bioconductor 多数软件包采用 R 统计编程语言开发。Bioconductor 每年释出两个版本，并有活跃的用户社区。 由于 Bioconductor 的 rsync 上游会自行删除非最新的版本，大部分镜像站仅提供 Bioconductor 的当前最新版本和开发版本，只有少量镜像站点会保留过时的版本。目前已知西湖大学…
Steven Shum
A Bioinformatics Engineer.
1.3.6-R 4
180 98 R 语言中的 libpng 版本冲突
事情起因是在 R 语言中调用 png 包的 readPNG 读取 png 图片的时候，碰到了错误：libpng error: Incompatible libpng version in application and library。 这个问题，其实在 《RamiGO 安装及库依赖解决备忘》曾经遇到过，当时的解决方法，在现在看起来其实是并不完善的。所以，在问题解决前，我们先来看看这个问题到底是怎…
87 GCC 版本不一致导致的 R magick 包安装错误
在安装 Y 叔的 yyplot 时候，发现 magick 依赖包安装的时候的一些棘手问题，特此记录一下。 仅在 Bash 环境配置了 PATH 和 PKG_CONFIG_PATH 是不够的，安装过程会提示动态库的问题。 最终解决方案： 手动安装 ggimage_0.3.1。 配置必要环境。 安装。根据提示，先安装缺失的 meme 包，然后再安装 yyplot。 R-4.3.0 安装 magick_…
85 R 包安装指定 GCC 和 G++ 并开启 C++11 支持
如果你的 R 是使用比较低版本的 GCC（如 Red Hat 6.5 + GCC/G++ 4.4.7），但安装的 R 包需要开启 C++11 支持，或者需要更高版本的 GCC 和 G++，可以参考一下这个方法。 首先，在 home 目录创建一个 ~/.R/Makevars 文件。 然后，在 Makevars 文件中加入以下内容。 最后，重新打开 R，执行对应包安装。 参考资料： ERROR: co…
